计算化学公社

标题: 请教文章中小分子结构中氢的展示问题 [打印本页]

作者
Author:
5撇到3撇    时间: 2021-11-8 22:30
标题: 请教文章中小分子结构中氢的展示问题
请教下老师,某种药物的结构中含有氢原子,但是文献中作者在展示该药物与靶蛋白相互作用的时候,放的药物结构中不含氢原子,有点迷惑。而且,ligplot在作图的时候氢原子也是不显示的。所以想请教一下文章作图中的小分子结构的氢原子是否要显示出来呢?谢谢

作者
Author:
sobereva    时间: 2021-11-8 23:06
这个完全随你。氢的数目通常比较多,都显示出来太乱,妨碍主体结构的观看,而且氢又不是关注的主要对象,所以往往隐去
但如果药物与靶点之间有氢键,这样的氢是绝对要显示出来的
作者
Author:
5撇到3撇    时间: 2021-11-8 23:52
sobereva 发表于 2021-11-8 23:06
这个完全随你。氢的数目通常比较多,都显示出来太乱,妨碍主体结构的观看,而且氢又不是关注的主要对象,所 ...

谢谢老师,还有就是 在展示成氢键的氢同时非极性氢可以隐藏吗?还是均显示出来?
作者
Author:
sobereva    时间: 2021-11-8 23:52
5撇到3撇 发表于 2021-11-8 23:52
谢谢老师,还有就是 在展示成氢键的氢同时非极性氢可以隐藏吗?还是均显示出来?

可以,图题里注明这点即可
作者
Author:
5撇到3撇    时间: 2021-11-8 23:55
sobereva 发表于 2021-11-8 23:52
可以,图题里注明这点即可

明白谢谢老师!




欢迎光临 计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3