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标题: 求教优化一个夹层化合物方法和基组选择，怎样算可以缩短耗时？ [打印本页]

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Author: wy标点人生 时间: 2021-7-21 22:20
标题: 求教优化一个夹层化合物方法和基组选择，怎样算可以缩短耗时？
各位老师，我最近在优化一个夹层化合物，很多次都没成功，算了几天了。它含有过渡金属，其中19个Ge、3个pd、3个P、9个苯环，还带有负电荷。希望各位老师可以建议一下使用的方法和基组，指点一下我，非常感谢！（我现在想先用一个小基组进行优化，然后再用大基组优化。）目前用的是PBE0/def2tzvp。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-21 22:58
先把def2TZVP减到def2SVPP。如果还不行，把PBE0换成BP86然后开密度拟合。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-22 02:01
Ge和Pd用lan08(d)，其它用6-311G*

说清楚计算资源，否则没法准确推荐。反正一般情况优化都不要用def2-TZVP那么大，带f极化太耗时

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-7-22 12:46
本帖最后由 wy标点人生于 2021-7-22 12:50 编辑

sobereva 发表于 2021-7-22 02:01
Ge和Pd用lan08(d)，其它用6-311G*

说清楚计算资源，否则没法准确推荐。反正一般情况优化都不要用def2-TZ ...

好的，谢谢卢老师！计算资源的话，有13个节点，每个节点40核，目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算的慢

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-7-22 12:50

wzkchem5 发表于 2021-7-21 22:58
先把def2TZVP减到def2SVPP。如果还不行，把PBE0换成BP86然后开密度拟合。

嗯，谢谢老师，我会参考的！密度拟合怎么开呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-22 14:51

wy标点人生发表于 2021-7-22 05:50
嗯，谢谢老师，我会参考的！密度拟合怎么开呢？

http://gaussian.com/densityfit/

作者
Author: 风飞 时间: 2021-7-22 21:28

wy标点人生发表于 2021-7-22 12:46
好的，谢谢卢老师！计算资源的话，有13个节点，每个节点40核，目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算 ...

其实，你可以说的更清楚些，例如，CPU的型号（包括主频）之前似乎看到过高斯的多节点的并行效率不高，群里好像有相关的帖子，建议可以先简单测试一下，再计算，这样可以节约时间

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-23 03:29

wy标点人生发表于 2021-7-22 12:46
好的，谢谢卢老师！计算资源的话，有13个节点，每个节点40核，目前只有我一个人用。但是我发现这个超算算 ...

如果你是跨节点跑的，不要跨节点，否则如果只是以太网方式互联节点，跨节点跑Gaussian比不跨还慢
Gaussian最适合的是在单个胖节点上跑

当前计算资源情况下，单节点40核并行，用我前面推荐的级别优化不会多费劲

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-7-23 22:39

风飞发表于 2021-7-22 21:28
其实，你可以说的更清楚些，例如，CPU的型号（包括主频）之前似乎看到过高斯的多节点的并行效率不高， ...

好的，谢谢老师！
CPU：Intel XEON V4处理器E5-2600系列，配置2路40物理核80计算核心，64位，中心处理器主频2000MHz,三级缓存2*50M=100MCACHE

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-7-23 22:40

sobereva 发表于 2021-7-23 03:29
如果你是跨节点跑的，不要跨节点，否则如果只是以太网方式互联节点，跨节点跑Gaussian比不跨还慢
Gaussi ...

好的，谢谢老师！

作者
Author: wy标点人生 时间: 2021-7-23 23:04

wzkchem5 发表于 2021-7-22 14:51
http://gaussian.com/densityfit/

好的，谢谢老师，我先前看看！

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