计算化学公社

标题: 有使用过配体埋藏体积的计算软件sambvca吗？有没有编译成桌面版的？ [打印本页]

作者
Author: 星斗如盘 时间: 2021-7-10 08:04
标题: 有使用过配体埋藏体积的计算软件sambvca吗？有没有编译成桌面版的？
sambvca是计算配体埋藏体积的web版软件，但是云端服务器连接非常慢，而且不能批量运行，官网给出了源码，有没有编译成windows版本的软件？
官网网址：SambVca - Home Page (unisa.it)

作者
Author: sjsjsj25915302 时间: 2022-8-12 16:32
可以使用 Python 里的 Morfeus包里面也有求Vbur的功能 github：https://github.com/kjelljorner/morfeus 文档地址：https://kjelljorner.github.io/morfeus/buried_volume.html

作者
Author: zizi 时间: 2024-5-16 11:43
您好，我最近尝试使用此web版软件（https://www.aocdweb.com/OMtools/sambvca2.1/index.html）计算埋藏体积，但是在最后一步提交之后一直出现错误“internal error：cannot open file input file”。由于之前使用时未出现此问题，不知是否为web版的问题。我尝试在此官网下载源码亦失败。不知您是否下载过源码，若下载过请问是否可以请您分享一下？非常感谢！

作者
Author: dhz 时间: 2025-2-18 16:26

zizi 发表于 2024-5-16 11:43
您好，我最近尝试使用此web版软件（https://www.aocdweb.com/OMtools/sambvca2.1/index.html）计算埋藏体 ...

请问解决了吗

作者
Author: Santz 时间: 2025-2-18 17:18

dhz 发表于 2025-2-18 16:26
请问解决了吗

sambvca

作者
Author: QuantumicGuy 时间: 2025-4-28 17:33

sjsjsj25915302 发表于 2022-8-12 16:32
可以使用 Python 里的 Morfeus包里面也有求Vbur的功能 github：https://github.com/kjelljorner/morfeus ...

请问怎么用python调用morfeus

from morfeus import read_xyz

复制代码

ModuleNotFoundError: No module named 'morfeus'

复制代码

按照官方手册安装的：

pip install morfeus-ml

复制代码

作者
Author: yangjusong 时间: 2025-6-16 18:29

Santz 发表于 2025-2-18 17:18
sambvca

您好，请问这个是linux的安装包吗？是怎么使用的，新手求教。万分感谢！

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