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标题: 想模拟低共熔溶剂+水体系,水模型选用哪个比较合适呢? [打印本页]

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二饼妹    时间: 2021-7-5 16:35
标题: 想模拟低共熔溶剂+水体系,水模型选用哪个比较合适呢?
想模拟低共熔溶剂+水体系,水模型选用哪个比较合适呢?
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牧生    时间: 2021-7-5 16:43
opc水模型
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sobereva    时间: 2021-7-5 18:29
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“水模型的选取”改了,以后务必注意

之前http://bbs.keinsci.com/thread-23825-1-1.html里我就已经提醒过你一次,如果下次发帖标题还违规,我就要严厉处理了

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二饼妹    时间: 2021-7-5 21:41
sobereva 发表于 2021-7-5 18:29
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的老师,以后一定严谨。
老师如果我想在原有的低共熔溶剂盒子(packmol创建的)中加入250个OPC水分子,应该怎么操作呢?
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nianbin    时间: 2021-7-6 00:49
gmx gmx insert-molecules -cs

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sobereva    时间: 2021-7-6 07:47
二饼妹 发表于 2021-7-5 21:41
好的老师,以后一定严谨。
老师如果我想在原有的低共熔溶剂盒子(packmol创建的)中加入250个OPC水分子 ...

gmx solvate结合-cs tip4p.gro -maxsol 250
或者直接用packmol插入
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二饼妹    时间: 2021-7-6 09:58
sobereva 发表于 2021-7-6 07:47
gmx solvate结合-cs tip4p.gro -maxsol 250
或者直接用packmol插入

谢谢老师!




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