计算化学公社

标题: 请问大家用charmm-gui建模后的步骤 [打印本页]

作者
Author: namd学者 时间: 2021-5-13 15:06
标题: 请问大家用charmm-gui建模后的步骤
如题，最近用charmm-gui建了模型，并且还给了我使用的模拟软件（NAMD）的配置文件，可是其中的文件太多了，我使用文件7来运行时，提示出错。所以想请问大家，charmm-gui生成的文件是从哪一个文件开始运行呢？还是说要自己重新写呢？

作者
Author: fhh2626 时间: 2021-5-13 19:13
建议用step5的psf和pdb，然后自己写config文件

作者
Author: namd学者 时间: 2021-5-13 19:44

fhh2626 发表于 2021-5-13 19:13
建议用step5的psf和pdb，然后自己写config文件

谢谢老师的回答。老师我想问下他这个Inp文件中的 exec sed -e "s/\$FC/200/g" restraints/dihe.txt > restraints/$outputname.dihe这种语句是什么意思呢？

作者
Author: liupeng 时间: 2021-11-12 15:47
怎么申请charmm-gui的账号呢？

作者
Author: liupeng 时间: 2021-11-12 15:48
如何申请charmm-gui的账号呢？

作者
Author: CHJ2841666311 时间: 2023-9-17 20:30
需要学术机构邮箱的

作者
Author: 许正东 时间: 11 hour ago

liupeng 发表于 2021-11-12 15:48
**** 作者被禁止或删除内容自动屏蔽 ****

学校的edu.cn邮箱申请，很快就会通过。

欢迎光临计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/)