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标题: 安装deepmd套件、deepchem、rdkit等软件包的python环境 [打印本页]

作者
Author: ccjjww25 时间: 2021-3-24 12:30
标题: 安装deepmd套件、deepchem、rdkit等软件包的python环境
*2021-03-18 By Junwu Chen at CAS IPE, Beijing*
来自我的[github](https://github.com/jwchen25/study_deepmd)

方法1 (Method 1)

### 1. 安装anaconda或miniconda (install anaconda/miniconda)

### 2. 用conda创建python3.6的虚拟环境 (create a python3.6 virtual environment by conda):

conda create -n deepc python=3.6 libprotobuf==3.8.0

复制代码

激活刚创建的python虚拟环境 (activate the created virtual environment):

conda activate deepc

复制代码

### 3. 安装deepmd-kit (install deepmd-kit):

conda install deepmd-kit=*=*cpu lammps-dp=*=*cpu -c deepmodeling

复制代码

### 4. 安装dpgen0.8.1 (install dpgen 0.8.1):```
pip install pymatgen==2019.6.5 \
         monty==2.0.4 \
         ase==3.17.0 \
         paramiko==2.6.0 \
         custodian==2019.2.10 \
         dpgen==0.8.1
```
### 5. 安装deepchem (install deepchem):

pip install deepchem==2.5.0

复制代码

### 6. 安装rdkit (install rdkit):

conda install -y -c conda-forge rdkit

复制代码

### 安装结束

方法2 (Method 2)

## 使用yml快速配置conda虚拟环境 (Use .yml file to quickly configure the conda virtual environment)
### 1. 安装anaconda或miniconda (install anaconda/miniconda)

### 2. 从.yml文件创建python虚拟环境 (Use .yml file to create desired conda virtual environment):

conda env create -f deepc_environment.yml

复制代码

deepc_environment.yml文件在我的github中可以找到(https://github.com/jwchen25/study_deepmd)

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