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标题: 轨迹文件提取坐标和扩胞求助 [打印本页]

作者
Author: 风飞 时间: 2020-6-11 08:52
标题: 轨迹文件提取坐标和扩胞求助
本帖最后由风飞于 2020-6-11 12:00 编辑

老师，您好，
1. 使用CASTEP做优化MgAl2O4的111面，昨天晚上都还是正常的，今天早上来看，感觉都没有跑，能量/力等收敛的轨迹没变，状态确是runing,我看了CPU的占用情况，从昨天晚上的87%，今天早上却是2%，于是想结合能量收敛，提取轨迹文件中的某个结构再次优化，请问该怎样做呢？打开MS的.xtd文件看不懂，想用之前老师写的脚本转换成.XYZ格式，出现错误为：The document does not contain a trajectory (function/property "Trajectory") at -e line 31.

请问该怎样处理呢？

2.对MgAl2O4（111）进行扩胞，变成3*3*1. 请问是这bluck基础上进行切面-真空-超胞，还是在primitive基础上切面-真空-超胞呢？

作者
Author: 浪啊我是 时间: 2020-6-12 14:34
同时打开xtd文件和收敛的曲线图两个窗口，鼠标选择曲线图中的某一个点的时候，xtd的轨迹图也会对用着你选择的点变化的，变化后的xtd上的那一帧就是你需要的的，然后export就行。

作者
Author: 风飞 时间: 2020-6-13 08:55

浪啊我是发表于 2020-6-12 14:34
同时打开xtd文件和收敛的曲线图两个窗口，鼠标选择曲线图中的某一个点的时候，xtd的轨迹图也会对用着你选择 ...

恩，好的谢谢你

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-6-13 16:56

风飞发表于 2020-6-13 08:55
恩，好的谢谢你

1、xtd已经够方便了，没必要去折腾。

正常停止任务后返回计算结果，计算的轨迹将会保存在xtd，如果不返回则没有数据。在激活xtd的状况下，找找工具条上是否有Animation工具，如果没有，则在view->toolbars->Animation工具，然后有个类似于播放、停止这样的按钮，点击播放或者下一帧找到你要的结构的对应帧，把那个结构拷贝到xsd继续跑就行了。

2、一般切面对应的指数应该是定义在单胞上的。

作者
Author: 风飞 时间: 2020-6-17 22:18

卡开发发发表于 2020-6-13 16:56
1、xtd已经够方便了，没必要去折腾。

正常停止任务后返回计算结果，计算的轨迹将会保存在xtd，如果不 ...

嗯，好的谢谢老师

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