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标题: MS中怎么制作局部位置的电子密度云图？ [打印本页]

作者
Author: 田雄伟 时间: 2020-5-25 12:31
标题: MS中怎么制作局部位置的电子密度云图？
请教一下大家，MS软件如何显示局部某些原子的电子密度云图呢？我现在只是能显示整个体系的云图（如图所示），但这样子非常乱，无法突出重点，烦请各位高手帮忙指点一二，不胜感激！

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-5-26 18:50
在Display styles里面的field能设置密度网格的范围默认应该是0~1，但是可以改成其他分数，不过应该只能限制方形区域，要搞更复杂的只能写程序去修改grd文件。

作者
Author: sobereva 时间: 2020-5-27 05:21
如果盒子是矩形的，可以用Multiwfn载入grd文件，利用主功能13的主功能13的格点数据屏蔽功能把不想要的区域的数值设为0，参看Multiwfn手册4.13.4节的例子。之后让Multiwfn导出成cube文件，就可以在VMD、VESTA等程序里观看处理后的等值面

作者
Author: ChinaHowe 时间: 2020-5-28 09:23
本帖最后由 ChinaHowe 于 2020-5-28 09:29 编辑

卡开发发发表于 2020-5-26 18:50
在Display styles里面的field能设置密度网格的范围默认应该是0~1，但是可以改成其他分数，不过应该只能限制 ...

前辈，您好。请问一下Windows平台下MS计算出来的3D格点数据，现在有没有其他第三方软件处理并进行可视化的，麻烦您推荐第三方处理软件。（castep下的差分密度数据）

作者
Author: 卡开发发 时间: 2020-5-28 09:38

ChinaHowe 发表于 2020-5-28 09:23
前辈，您好。请问一下Windows平台下MS计算出来的3D格点数据，现在有没有其他第三方软件处理并进行可视化 ...

http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mjr/vis/，转换成啥格式咋显示就看你自己需求了。

作者
Author: ChinaHowe 时间: 2020-5-28 20:37

卡开发发发表于 2020-5-28 09:38
http://www.tcm.phy.cam.ac.uk/~mjr/vis/，转换成啥格式咋显示就看你自己需求了。

谢谢您。现在我也是装了centos，正在学习如何在该虚拟机下安装C2X。谢谢您，祝您工作愉快

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