计算化学公社

标题: 求助castep优化中的问题,请各位帮忙分析一下 [打印本页]

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lzc    时间: 2015-9-9 09:14
标题: 求助castep优化中的问题,请各位帮忙分析一下
castep提交任务是出现提示:Converting to higher symmetry will significantly improve the speed of this calculation.
If you want to make this conversion choose Yes.
If you want to proceed with P1 symmetry choose No.

请问这个应该如何选择?我做的体系是表面吸附相关,建立的是一个6层的模型并加了一定厚度的真空层。选择yes是高对称性优化,优化时间短了很多,但是优化以后结构基本发生变化(很难保持原来的状态,原子跟真空层很难像一开始建立表面一样保持在同一晶胞内。)选择No是make P1后进行优化,优化时间明显增长,但是优化的结构基本保持原来状态(晶体及真空层与一开始建立时的差不多,只是层间距发生了变化)。 (, 下载次数 Times of downloads: 62) (, 下载次数 Times of downloads: 74) (, 下载次数 Times of downloads: 77)
想请教一下各位前辈,选择yes及no到底有什么区别?什么情况下选择yes,什么情况下选择no?特别是我做表面研究的话应该如何选择?非常感谢

作者
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lzc    时间: 2015-9-9 09:18
上面三个图分别表示:上左  优化前结构         上右 选择no优化的结构,与优化前的结构相差不大        下:选择yes后优化的结构,真空层跑到下面来了,选择不同的显示方式也很难回到优化前的那种结构情况,比如original显示也跟原来的结构很大的差别。麻烦各位前辈帮忙分析一下
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卡开发发    时间: 2015-9-9 12:20
表面体系不要使用对称性
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helpme    时间: 2015-9-9 13:05
1. 由于有周期性,真空层在哪里应该没有什么关系。
2. 为什么表面体系不适合用周期性呢(除了程序本身的因素)?
比如,如果在表面一个对称位置吸附一个H原子是体系势能面的一个极小点,那么加上对称应该也可以吧?
我觉得是否采用对称性,取决于你是否想对体系加上这么一个约束,或者说,体系加上这个约束是否合理。
想听听 卡开发发 大侠的意见。

作者
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卡开发发    时间: 2015-9-9 14:25
本帖最后由 卡开发发 于 2015-9-9 14:43 编辑
helpme 发表于 2015-9-9 13:05
1. 由于有周期性,真空层在哪里应该没有什么关系。
2. 为什么表面体系不适合用周期性呢(除了程序本身的因 ...

不是说不适合,只是不建议使用,有如下原因:

1、如LZ所言,有时候使用了对称性结构就很难再转换为原来的情形,晶格基矢变换就和猜谜差不多了;
2、对称性的识别没有那么机智,比如一个反铁磁纯金属的体系,在寻找对称性之前不适当施加约束,所有原子全都一样,指定磁矩的时候也就会出现问题,对于表面体系复杂程度更高,使用就需要相当慎重;
3、对于某些体系,采用对称性减小晶格或原子数相应使用k就增加,不见得总能起到加速效果(甚至反而慢)

请前辈赐教。
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lzc    时间: 2015-9-10 09:22
卡开发发 发表于 2015-9-9 14:25
不是说不适合,只是不建议使用,有如下原因:

1、如LZ所言,有时候使用了对称性结构就很难再转换为原 ...

谢谢老师,非常感谢您的解答!受教了。谢谢谢谢。祝您节日快乐!
作者
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lzc    时间: 2015-9-10 09:24
helpme 发表于 2015-9-9 13:05
1. 由于有周期性,真空层在哪里应该没有什么关系。
2. 为什么表面体系不适合用周期性呢(除了程序本身的因 ...

谢谢您的分析,看来这个需要综合考虑我自身所研究的体系。非常感谢,我再仔细研究一下!在这个特殊的日子也祝您节日快乐!
作者
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卡开发发    时间: 2015-9-10 09:54
lzc 发表于 2015-9-10 09:22
谢谢老师,非常感谢您的解答!受教了。谢谢谢谢。祝您节日快乐!

哈哈,不是老师,作为讨论而言大家相互为师,同乐同乐。
作者
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helpme    时间: 2015-9-10 19:18
卡开发发 发表于 2015-9-9 14:25
不是说不适合,只是不建议使用,有如下原因:

1、如LZ所言,有时候使用了对称性结构就很难再转换为原 ...

原来实际计算时,加了对称性可能引发这么多问题。学习了。





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