计算化学公社

标题: CP2K OMP并行运行出错求助 [打印本页]

作者
Author:
zhou9527    时间: 2020-4-5 11:22
标题: CP2K OMP并行运行出错求助
大家好!我参照网上教程在集群上编译好了CP2K (普通用户),用的intel-2019的编译器(也试过intel-2016),然后Openmpi-3.0,编译了多线程并行的cp2k.psmp; 但是用OMP的话就是出现左一的错误;但是用intelmpi的话,却可以正常运行,但是运行几个小时后会习惯性的出错,大概就是说mpi fatal error 这些的;所以总体感觉可能是OMP的问题,但只是猜测,google 了很久,还是没解决,希望大家多多指教!谢谢!附图2是我设置的环境变量(都没有什么问题),图3 是Linux-x86-64-intel.psmp的文件,图4是我在集群提交作业的脚本。 (, 下载次数 Times of downloads: 24) (, 下载次数 Times of downloads: 27) (, 下载次数 Times of downloads: 27) (, 下载次数 Times of downloads: 23)

作者
Author:
mizuchi    时间: 2020-4-5 14:40
FC = mpifort
this ^ option let CP2K to be compiled with OpenMPI. Please note that the OpenMPI package itself should be build by Intel Suite.
作者
Author:
zhou9527    时间: 2020-4-5 15:05
mizuchi 发表于 2020-4-5 14:40
FC = mpifort
this ^ option let CP2K to be compiled with OpenMPI. Please note that the OpenMPI packa ...

哦哦,您的意思我额外装OMP,是多余的是吗
作者
Author:
zhou9527    时间: 2020-4-6 09:23
重新编译了一次问题解决了
作者
Author:
MADAOLay    时间: 2020-4-13 17:34
你好,我也在编译cp2k上遇到了麻烦,请问可以求一下你参考的cp2k编译教程吗?
作者
Author:
zhou9527    时间: 2020-6-1 16:49
MADAOLay 发表于 2020-4-13 17:34
你好,我也在编译cp2k上遇到了麻烦,请问可以求一下你参考的cp2k编译教程吗?

不好意思没看到; 你可以参考这个教程https://blog.csdn.net/zh314js/article/details/76258705




欢迎光临 计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3