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标题: 刚开始学习multiwfn神器,菜鸟一个,有些问题咨询一下 [打印本页]

作者
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lastzealot    时间: 2015-9-3 00:16
标题: 刚开始学习multiwfn神器,菜鸟一个,有些问题咨询一下
本帖最后由 lastzealot 于 2015-9-3 00:36 编辑

1. 总能看到HF和post-HF,都是啥意思呢?我常用的是B3LYP,也用过MP2。这些泛函都是如何来划分呢?
2. Multiwfn Manual中提到(P31),Multiwfn determines if atoms are bonded by empirical distance criteria, if the distance between two atoms is short than 1.15 times of the sum of their van der wals radii, they will be considered as bonded. 我想问的是:1.15这个值是怎么来的?约定俗成的吗?还是有文献可查呢?(这涉及到我前一段时间问您的关于M-sulfur成键的问题,如果直接通过键长和范德华半径的比较就可以初步判断是否成键,那就方便了好多呀!)另外,这里所说的那个范德华半径是不是在百度中查到的那些数值呢?还是在multiwfn中有这个范德华半径的数值呢?
3. 请问结构图的清晰度可以通过什么来调节呢?

谢谢sob老师,以后还会有好多问题要咨询您,麻烦了。



作者
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sobereva    时间: 2015-9-3 00:49
1 post-HF就是在HF方法基础上考虑了电子库仑相关,使得结果更精确,MP2是最廉价的post-HF方法。B3LYP是泛函,和post-HF一样考虑了电子相关从而结果好于HF,但是是以更廉价的方式考虑,泛函选好了则精度可以达到低挡乃至中档post-HF的水平。Levine的quantum chemistry你看看就明白这些概念了。

2 1.15只是个经验值,我发觉这个值一般比较合适。gview、VMD等程序判断是否成键也都是用的类似的经验关系。

半径问题这里有讨论:
简谈原子半径
http://sobereva.com/255


3 “清晰度”这个词太含糊。如果你是指图像像素大小,用settings.ini里的参数调,手册有说明:
For curve maps, the height and weight of the picture are controlled by “graph1Dsize”
parameter in settings.ini, “graph2Dsize” is responsible for two-dimension data plotting (colorfilled
map, contour map, relief map, etc.), “graph3Dsize“ is responsible for three-dimension data
plotting (isosurface graph, molecular structure graph).




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