计算化学公社

标题: 关于DMOL3对吸附模型进行计算后的分析问题 [打印本页]

作者
Author: youtuBo 时间: 2019-12-5 15:53
标题: 关于DMOL3对吸附模型进行计算后的分析问题
因为初学计算，使用dmol3对吸附模型进行计算后，有一些相关分析不明白：
1.我计算的是高岭土的周期模型，是否可以计算Fukui指数？
2.想要进行布居分析，在计算时选择了Mulliken电荷，但是想要知道键布居具体是在哪里查看。我看文献说键布居正表示共价键，负表示离子键，但是我计算后想在label里显示bond order，但是每一个键都显示为1.000，所以键布居到底是不是在这里查看？我还看到别人说：布居分析中，正表示成键，负表示反键，值大小表示成键的程度，在这里的正负又是指的什么值呢？
3.DOS图和能带结构图说是要一起查看，但是能够从这两张图中得到一些什么有效的信息呢？我看别人可以通过PDOS图等看出原子的杂化情况，但是我不明白杂化情况又是如何帮助成键分析的？
4.我是想要分析分子在表面上的吸附情况，初步想要通过分析布居、成键相关原子的PDOS、键长、等，帮助我理解分析是如何吸附在表面的，考虑这些可以吗？我首先通过吸附能进行了一个初步的判断，然后通过分析这些想要进一步分析成键原理，但是现在对许多分析都还不是很了解，得出的结果也不知道如何帮助

问题有点多，希望大家救救我♥

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-5 17:02
1 算不了

2 “键布居正表示共价键，负表示离子键”这纯粹是瞎说。Mulliken重叠布居（键布居）没法体现成键类型。
判断成键类型的做法看
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471（http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html）
（Multiwfn不支持Dmol3）

3 跟成键没那么直接的关系

4 你可以导出优化后的几何结构，做个IGM分析，这是目前很流行的分析相互作用特征的方法
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407（http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html）

如果你恰当构造个团簇模型，用诸如Gaussian、ORCA等量化程序算个单点任务得到波函数文件，再用Multiwfn一分析，作用本质就能研究得极为透彻，并可能能成为文章的亮点。看前面提及的文章以及下文
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

诸如这篇ACS Catal. 2018, 8, 3825−3832对就是个很好的研究范例，VASP做表面计算，然后Gaussian+Multiwfn做个分析，把弱相互作用复合物的结合和催化过程的成键作用分析得很透彻

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