计算化学公社
标题:
VMD怎么加载VASP算好的差分电荷密度呢
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作者Author:
qwe1832518773
时间:
2019-12-1 14:33
标题:
VMD怎么加载VASP算好的差分电荷密度呢
本帖最后由 qwe1832518773 于 2019-12-2 14:21 编辑
该问题已经解决,感谢啦啦黑还黑的回复以及社长博客的启发!
算好的CHGCAR_diff可以用脚本chg2cube.pl来转化成cube文件,后者就可以在vmd里打开,具体的图片调教我是参考的社长的vmd脚本(
http://sobereva.com/449
)
-----以下是原问题--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
看到有一篇文献 Phys. Chem. Chem. Phys., 2015, 17, 14495
(, 下载次数 Times of downloads: 41)
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里用VMD画了很好看的等密度电荷图,但是自己将算好的CHGCAR_diff拖入VMD后VMD直接卡死奔溃了。。。像求助一下究竟该怎么操作才能画出这样的图呢
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作者Author:
啦啦黑还黑
时间:
2019-12-1 16:04
建议用Vesta看。如果非要用VMD,先在VESTA里转成cube格式的文件,再导入到VMD
作者Author:
qwe1832518773
时间:
2019-12-1 20:06
啦啦黑还黑 发表于 2019-12-1 16:04
建议用Vesta看。如果非要用VMD,先在VESTA里转成cube格式的文件,再导入到VMD
好的我试试,谢谢
作者Author:
qwe1832518773
时间:
2019-12-1 20:11
本帖最后由 qwe1832518773 于 2019-12-1 20:13 编辑
啦啦黑还黑 发表于 2019-12-1 16:04
建议用Vesta看。如果非要用VMD,先在VESTA里转成cube格式的文件,再导入到VMD
vesta该怎么转成cube格式呢,我在export里面没有找到cube格式,我的vesta版本是3.4.3
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