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标题: 求助gromacs中comb-rule的选择 [打印本页]

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少年爱吃地三鲜    时间: 2019-6-17 14:59
标题: 求助gromacs中comb-rule的选择
对于gromacs中的非键范德华相互作用,gromacs中有两种势函数的表达形式,分别对应 类型1:c6 c12 和 类型2 与类型3: sigma      epsilon  老师 我想请问 这里面的类型是否对应着comb-rule的组合规则?另外 ,我想请问 假如势函数形式如图,我该如何在 2 和 3 中选择comb-rule? 谢谢老师了!

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少年爱吃地三鲜    时间: 2019-6-17 15:01
类型2是利用算是平均计算sigma 利用几何平均计算 epsilon,类型三是都利用几何平均计算sigma 和 epsilon ,文中没提到用什么计算  只有sigma      epsilon两个参数的情况下,我该如何抉择呢?
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sobereva    时间: 2019-6-17 20:49
你截的图里不体现应该用什么comb-rule。如果文章涉及了多种粒子,这是作者理应提及的
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少年爱吃地三鲜    时间: 2019-6-17 21:14
sobereva 发表于 2019-6-17 20:49
你截的图里不体现应该用什么comb-rule。如果文章涉及了多种粒子,这是作者理应提及的

感谢您!




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