计算化学公社

标题: amber savePdb不成功 [打印本页]

作者
Author: alystone 时间: 2015-6-21 11:55
标题: amber savePdb不成功
Welcome to LEaP!
(no leaprc in search path)
> edit bmi.pdb
Creating a new, empty UNIT "bmi.pdb"
> savepdb bmi bmi.pdb
savePdb: Argument #1 is type String must be of type: [unit]
usage: savePdb <object> <filename>

在xleap里画完图保存命令的时候，总是保存不了，弹出这个错误。请问我是哪里错了吗？名字我试了很多，都不行

作者
Author: sobereva 时间: 2015-6-21 12:59
你的unit名字没搞对。
你用edit bmi.pdb，就说明unit名字叫bmi.pdb，因此你用savepdb的时候，第一个参数也得是bmi.pdb而不能是bmi

尽量不要把unit名字和文件名弄成一致。

作者
Author: tbw@zyc 时间: 2015-6-21 14:49
unit 要和PDB里的残基名一致

作者
Author: alystone 时间: 2015-6-22 10:49
谢谢sob老师和tbw@zyc，明白了

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