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标题: 求助差分密度图的调整 [打印本页]

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華華    时间: 2019-4-29 11:05
标题: 求助差分密度图的调整
求助各位老师,看文献中的差分密度图是第一张图这样的,但是我在DMOL3中画出来的电子密度红蓝的颜色特别不明显(第二张图),请问怎么才能调出文献中这样的呢?期待您的解答,万分感谢!!!
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sobereva    时间: 2019-4-29 14:31
上头那是截面图,你的是等值面图。把透明改成不透明还能看着区分度高一些
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華華    时间: 2019-4-30 15:36
sobereva 发表于 2019-4-29 14:31
上头那是截面图,你的是等值面图。把透明改成不透明还能看着区分度高一些

谢谢sob老师的解答
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華華    时间: 2019-4-30 16:02
老师好,按老师说的我做出了截面图,第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的,第二张图是按一些帖子说的AB-A-B计算密度差得到的,但是有些问题想请教一下
    1、第二张图中的蓝色中间有红色,那这种的话是得电子还是失电子呢,还是画的图有什么问题呢?
    2、如果要分析吸附结构的电子得失直接用第一个可以吗?O原子得电子,Ti失电子,但是在Ti原子上有点红色,但是其他周围是蓝色这种应该怎么分析呢?
    3、在文献中的 charge density difference可以用来说明图一吗?
刚开始接触性质的分析,希望得到老师的指点,万分感谢!!!

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hakuna    时间: 2019-4-30 16:52
華華 发表于 2019-4-30 16:02
老师好,按老师说的我做出了截面图,第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的,第二 ...

密度差只能定性地讨论一下电荷转移情况,能用等直面就不要去切面,要切就要弄准确位置,随便切一个出来,神见了也发愁。
别期待通过密度差讨论原子的电子得失,讨论原子还是算电荷密度吧
密度差图上可以尝试把得、失电荷的区域与轨道对应一下,分析电荷转移状况,可以查看吸附位原子间是否有点和聚集.....最好与DOS关联起来对理解会有帮助
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華華    时间: 2019-4-30 17:07
hakuna 发表于 2019-4-30 16:52
密度差只能定性地讨论一下电荷转移情况,能用等直面就不要去切面,要切就要弄准确位置,随便切一个出来, ...

您好,我就是看文献里很多都是DOS和电荷密度差分析的,所以想做一下密度差,切截面的话是应该分析哪些原子就切那个面吗?我这个面切的是SO2和表面上的一个Ti原子,主要是想学习一下,切截面有哪些技巧吗?谢谢您的解答
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hakuna    时间: 2019-4-30 17:23
華華 发表于 2019-4-30 17:07
您好,我就是看文献里很多都是DOS和电荷密度差分析的,所以想做一下密度差,切截面的话是应该分析哪些原 ...

分析哪里切哪里
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華華    时间: 2019-4-30 19:29
hakuna 发表于 2019-4-30 17:23
分析哪里切哪里

明白了,谢谢老师
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sobereva    时间: 2019-5-1 06:25
華華 发表于 2019-4-30 16:02
老师好,按老师说的我做出了截面图,第一张图是DMOL3中直接计算出来的deformation density分析得到的,第二 ...

定量讨论原子上电荷的净变化量应当用原子电荷来考察。比如Hirshfeld电荷就相当于在Hirshfeld原子空间中对密度差这个函数进行积分取负值
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華華    时间: 2019-5-2 19:05
sobereva 发表于 2019-5-1 06:25
定量讨论原子上电荷的净变化量应当用原子电荷来考察。比如Hirshfeld电荷就相当于在Hirshfeld原子空间中对 ...

谢谢sob老师的解答




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