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标题: linux平台下chk转换为fchk出错显示‘’command not found ‘’ [打印本页]

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cornerj    时间: 2019-3-18 14:30
标题: linux平台下chk转换为fchk出错显示‘’command not found ‘’
请教Sob老师,
初次使用超算平台,l发现chk文件转化为fchk文件竟然出错!
输入:formchk XXX.chk
报错为:-bash: formchk: command not found 是找不到formchk工具么

此博文http://sobereva.com/379 详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
提及     "如果运行formchk时系统提示找不到此可执行文件,9成可能是机子里的Gaussian是菜鸟装的,步骤不合理。
如果你不知道怎么搞,索性直接用绝对路径指明formchk的路径,比如/sob/g09/formchk mizuki.chk。"

但尝试了输入 路径/g09/formchk xxx.chk 依旧是报错
没看明白这个路径问题,请问该如何解决?谢谢!
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highlight    时间: 2019-3-18 14:51
还是找不到,说明你的高斯不在那个目录下呗。去问管理员,确认一下高斯放哪了。
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liyuanhe211    时间: 2019-3-18 15:27
formchk在哪儿就输入什么路径。先用find命令找到它
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cokoy    时间: 2019-3-18 15:52
你打开你提交作业的脚本看一眼高斯的路径或者设置一下环境变量
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cornerj    时间: 2019-3-19 21:06
谢谢各位的回复!我刚尝试了下,找到绝对路径了,但敲命令回车后
/home-yw/Soft/g09/formchk
直接显示   ‘’ Killed ‘’
这是什么情况,该怎么处理?
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yuanyifan    时间: 2024-10-17 20:59
老师,请问你解决了吗?我遇见了同样的问题
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Loading0760    时间: 2024-10-18 09:59
yuanyifan 发表于 2024-10-17 20:59
老师,请问你解决了吗?我遇见了同样的问题

你的问题是什么?
-bash: formchk: command not found
还是
‘’ Killed ‘’

如果是前者,就是环境配置的问题。
在命令行直接输入g16,09版本同理,显示command not found吗?如果是那就说明你没加载Gaussian环境。如果不是,
输入which g16,看看路经在哪?一般来说formchk和g16是在同一个目录下,你可以检查一下,目录下有没有。
作者
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yuanyifan    时间: 2024-11-27 14:46
Loading0760 发表于 2024-10-18 09:59
你的问题是什么?
-bash: formchk: command not found
还是

好的,谢谢老师,我解决啦




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