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标题: 文件被删除的可能原因 [打印本页]

作者
Author:
zhou    时间: 2015-6-8 10:55
标题: 文件被删除的可能原因
本帖最后由 zhou 于 2015-6-8 11:08 编辑

老师好,
之前计算一个分子簇体系,输入文件如下:
(, 下载次数 Times of downloads: 32)
然后计算频率时终止了,输出文件结尾部分如下:
(, 下载次数 Times of downloads: 41)
我问了超算中心的老师,他们的删除记录里没有删除我的文件,从以前完成计算的输出文件里可以看到错误是出现在下面的地方:
(, 下载次数 Times of downloads: 41)
可以由此判断是什么文件出问题了吗?我的*.chk文件还在,还有补救措施吗?
如果重新算,有可能还会遇到这样的问题,太浪费时间了。
谢谢老师们啦!


作者
Author:
幻七熏    时间: 2015-6-8 11:02
高斯计算过程中的临时文件被删除了,有chk文件可以接着算
作者
Author:
zhou    时间: 2015-6-8 14:33
幻七熏 发表于 2015-6-8 11:02
高斯计算过程中的临时文件被删除了,有chk文件可以接着算

哦,谢谢!

作者
Author:
buttercup    时间: 2015-6-8 17:02
幻七熏 发表于 2015-6-8 11:02
高斯计算过程中的临时文件被删除了,有chk文件可以接着算

继楼主的问题而请教:
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题,我直接拷贝出中途chk文件,并在原输入中使用opt=restart 一直没能好用。在使用restart时有什么需要注意的吗?谢谢各位老师!

作者
Author:
幻七熏    时间: 2015-6-8 18:17
buttercup 发表于 2015-6-8 17:02
继楼主的问题而请教:
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题,我直接拷贝出中途chk文件 ...

可以参看heip里opt关键词
作者
Author:
sobereva    时间: 2015-6-8 23:46
buttercup 发表于 2015-6-8 17:02
继楼主的问题而请教:
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题,我直接拷贝出中途chk文件 ...


直接取最后结构继续优化就行了,没必要用restart。
作者
Author:
buttercup    时间: 2015-6-9 23:31
sobereva 发表于 2015-6-8 23:46
直接取最后结构继续优化就行了,没必要用restart。

恩恩,谢谢老师。我用restart没好用,我就这样取结构做了。不过对于irc有时这样做感觉起点就变了,就不是原本要继续的那个点了,会稍有差别
作者
Author:
buttercup    时间: 2015-6-9 23:32
幻七熏 发表于 2015-6-8 18:17
可以参看heip里opt关键词

好的,我之后看看,谢谢老师!
作者
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sobereva    时间: 2015-6-10 00:17
buttercup 发表于 2015-6-9 23:31
恩恩,谢谢老师。我用restart没好用,我就这样取结构做了。不过对于irc有时这样做感觉起点就变了,就不是 ...

IRC是应该restart,毕竟整个轨迹都要保留的。几何优化没必要,具体优化的过程无所谓,最终收敛就行了。




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