计算化学公社

标题: 在MS8.0中的DMol3的opt并行效率实测 [打印本页]

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-6-8 08:45
标题: 在MS8.0中的DMol3的opt并行效率实测

测试环境：

软件：Centos 7和MS 8.0。

硬件：双路主板上有两颗E5-2643v2，关闭超线程。另有64G内存和1T硬盘（肯定够用啦）。

测试体系：

一个三甲醇配位的酞菁钇配合物

(, 下载次数 Times of downloads: 152)

计算设置：

# Task parameters

Calculate optimize

Opt_energy_convergence 2.0000e-005

Opt_gradient_convergence 4.0000e-003 A

Opt_displacement_convergence 5.0000e-003 A

Opt_iterations 50

Opt_max_displacement 0.3000 A

Initial_hessian improved

Symmetry off

Max_memory 60000

File_usage smart

Scf_density_convergence 1.000000e-005

Scf_charge_mixing 2.000000e-001

Scf_spin_mixing 5.000000e-001

Scf_diis 6 pulay

Scf_iterations 50

# Electronic parameters

Spin_polarization unrestricted

Charge 0

Basis dnd

basis_version basfile_v4.4

Pseudopotential vpsr

Functional m06l

Aux_density octupole

Integration_grid medium

Occupation fermi

Cutoff_Global 4.8000 angstrom

Cosmo ibs

COSMO_Dielectric 32.6300 Methanol

# Print options

Print eigval_last_it

测试结果：

首先是一件令人高兴的事儿：每次测试，该计算任务都用了23个step达到opt收敛，不多不少。

五次测试，分别使用了单核心、双核心、四核心、八核心、十二核心。

看结果吧

(, 下载次数 Times of downloads: 155)

结论：DMol3的opt并行效率，与Gaussian 09 D 01的opt并行效率，两者对比，前者好得多！

参考：以前我测试过Gaussian 09 D 01的opt并行效率

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=581

作者
Author: wgbigfatcat 时间: 2015-6-8 09:49
可否给出测试的结构？我刚买了台双路2680v2，想做个对比测试。

作者
Author: qczgzly 时间: 2015-6-8 10:51
哇，DMol3好给力~不知道计算精度跟Gaussian相比如何呢？

作者
Author: ChemiAndy 时间: 2015-6-10 05:36
小卒出品, 有图有真相

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2015-6-11 16:54

qczgzly 发表于 2015-6-8 10:51
哇，DMol3好给力~不知道计算精度跟Gaussian相比如何呢？

DMOL3的泛函很少，精度也不够高，但是速度够快

作者
Author: luwis 时间: 2015-7-21 23:57
请问测试关闭超线程的用意是？谢谢 !

作者
Author: anmin0127 时间: 2015-10-18 15:26

yjcmwgk 发表于 2015-6-11 16:54
DMOL3的泛函很少，精度也不够高，但是速度够快

Dmol3的优势好像就是速度快，但是有些计算的精度还是有缺陷

作者
Author: whtu 时间: 2016-11-28 18:54
没做过并行测试，比较好奇怎么做出来的，不知道有没有教程？谢谢。

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