计算化学公社

标题: MS perl 脚本建模型,但perl脚本速度很慢,请问有没有其他比较快的建模办法呢? [打印本页]

作者
Author:
阳光下的尘    时间: 2019-2-15 11:55
标题: MS perl 脚本建模型,但perl脚本速度很慢,请问有没有其他比较快的建模办法呢?
大家好!
      我想用MS 建模型然后导入lammps中做计算,因为原子量在60万,因为模型重复性比较明显,所以打算用perl脚本建模。但问题是perl脚本建模速度太慢了。。。
      请问在MS里对于周期重复性比较明显的单元有没有比较快的建模方法呢?(当成聚合物建模也行,但是MS里聚合物好像只能有一个连接位点,我需要3个连接位点);或者直接建模在lammps里算,除了MS还有没有其他比较快的方式呢?
      谢谢大家!


作者
Author:
tjuptz    时间: 2019-4-22 08:47
可以考虑用VMD的TCL脚本




欢迎光临 计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3