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标题: CASTEP 计算吸附能时遇到的问题 [打印本页]

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CocuLiu    时间: 2018-11-27 16:18
标题: CASTEP 计算吸附能时遇到的问题
老师好,在help文件中学习用CASTEP计算吸附能,在向表面添加吸附的分子时,教程中(以CO为例)是一个原子一个原子进行添加的,还要计算距离,但是如果遇到一个较大的分子也需要一个一个画吗?能不能把整个分子拖进去??


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xylz6188    时间: 2018-11-27 16:36
直接copy然后paste就Ok了

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CocuLiu    时间: 2018-11-27 16:48
xylz6188 发表于 2018-11-27 16:36
直接copy然后paste就Ok了

谢谢您的回复。
还有几个问题需要请教,就是分子与表面之间距离怎样控制?
分子该如何摆放,比如某个带硝基的分子,硝基的朝向等,,这些都有影响吗?
还是说随便放置就可以。



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CocuLiu    时间: 2018-11-27 16:51
xylz6188 发表于 2018-11-27 16:36
直接copy然后paste就Ok了

另外还有,最强的吸附位点怎样确定?

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yiranfengbai    时间: 2018-11-27 19:21
MS中不是有个功能可以显示键长吗?你选中吸附点,再选中吸附分子中最低的那个原子,就可以显示出距离了,然后双击这个数值,就可以修改了啊。最强吸附点,就根据不同位置的吸附能呗,越大就是最强的吸附位置喽。
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xylz6188    时间: 2018-11-28 07:40
CocuLiu 发表于 2018-11-27 16:48
谢谢您的回复。
还有几个问题需要请教,就是分子与表面之间距离怎样控制?
分子该如何摆放,比如某个带 ...

(1)吸附距离,你自己手动调,最好配合Movement 功能来调节,一般控制在3A左右,不要靠得太近离得太远,可以节约时间。
(2)分子你可以摆不同的吸附构型,吸附剂也可以选不同的吸附位点,最后比较不同构型的吸附质在吸附剂不同位点的吸附能大小,判断最强吸附构型。
作者
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CocuLiu    时间: 2018-11-28 09:13
xylz6188 发表于 2018-11-28 07:40
(1)吸附距离,你自己手动调,最好配合Movement 功能来调节,一般控制在3A左右,不要靠得太近离得太远, ...

谢谢您
作者
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CocuLiu    时间: 2018-11-28 09:13
yiranfengbai 发表于 2018-11-27 19:21
MS中不是有个功能可以显示键长吗?你选中吸附点,再选中吸附分子中最低的那个原子,就可以显示出距离了,然 ...

谢谢您




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