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标题: 关于Dmol3寻找过渡态的问题 [打印本页]

作者
Author: CocuLiu 时间: 2018-11-17 20:29
标题: 关于Dmol3寻找过渡态的问题
老师好，
我首先用Dmol3模块对我的体系进行了动力学计算，生成的.xtd轨迹文件中可以观察到键的断裂和新键的生成，下一步想要用Dmol3模块来寻找过渡态，但是我不知道该怎样选取反应物和生成物的结构，希望老师您能给我一些指导。
谢谢您!

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-18 19:27
如果你发现的键的断裂/形成正好对应你要考察的过程，拿恰当的帧做几何优化，如果优化完了又正好看着像期望的反应物和产物，基于这俩结构去搜索过渡态

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