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标题: Amber如何在后台运行水分子 [打印本页]

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-9 14:29
标题: Amber如何在后台运行水分子
用amber计算一个分子，用Xshell与服务器相连。创建好了水盒子，在平衡电荷的时候，由于时间比较长，经常和服务器断开连接，求问各位大佬，有什么代码可以直接在后台进行电荷平衡计算的？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-9 14:46
用nohup [命令] &提交，用exit登出。这在此文里提到了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-9 15:03

sobereva 发表于 2018-11-9 14:46
用nohup [命令] &提交，用exit登出。这在此文里提到了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sob ...

谢谢sob老师，我去试试看

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-9 15:12

sobereva 发表于 2018-11-9 14:46
用nohup [命令] &提交，用exit登出。这在此文里提到了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sob ...

sob老师，您好。我的任务没有gjf文件，之前算别的分子的时候，都是直接在Xshell中输命令的，怎么在断开服务器连接的情况下仍然继续跑呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-10 00:48

Abandon-fmt 发表于 2018-11-9 15:12
sob老师，您好。我的任务没有gjf文件，之前算别的分子的时候，都是直接在Xshell中输命令的，怎么在断开服 ...

这和有没有gjf文件毫无关系
你把我的回复里的[命令]改成你的运行语句就完了

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-10 08:24

sobereva 发表于 2018-11-10 00:48
这和有没有gjf文件毫无关系
你把我的回复里的[命令]改成你的运行语句就完了

好的~谢谢sob老师

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-10 08:59

sobereva 发表于 2018-11-10 00:48
这和有没有gjf文件毫无关系
你把我的回复里的[命令]改成你的运行语句就完了

sob老师，我的命令是这样的
nohup addions2 m Cl- 0 &
但是报错ERROR: syntax error
不知道哪儿错了

作者
Author: sobereva 时间: 2018-11-10 09:15

Abandon-fmt 发表于 2018-11-10 08:59
sob老师，我的命令是这样的
nohup addions2 m Cl- 0 &
但是报错ERROR: syntax error

addions2得在leap里用啊
而且这样的命令瞬间就跑完了，何必放到后台去

作者
Author: Abandon-fmt 时间: 2018-11-10 10:17

sobereva 发表于 2018-11-10 09:15
addions2得在leap里用啊
而且这样的命令瞬间就跑完了，何必放到后台去

这个分子比较奇怪，之前算的分子确实是瞬间就出来了，这个要好久，久到和服务器断开连接。
sob老师有解决方法么？

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