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标题: 分子动力学模拟过程中力场的选择问题 [打印本页]

作者
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渠梦楠    时间: 2018-9-25 22:21
标题: 分子动力学模拟过程中力场的选择问题
各位前辈好,我在进行分子动力学模拟的过程中用的是charmm力场,软件为NAMD,由于我在常见的氨基酸上边加了糖类物质,而这种糖的力场参数我在toppar_c36_jul17.tgz中找到了,我看charmm力场中
charmm36适合用于gromacs,我想请教一下各位前辈这个可以用于NAMD中吗? 谢谢各位前辈!

作者
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sobereva    时间: 2018-9-26 20:20
我虽然不用NAMD,但是CHARMM是NAMD御用力场,能给其它程序用就不可能不能给NAMD用
作者
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greatzdk    时间: 2018-9-27 08:21
用charmm-gui
作者
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fhh2626    时间: 2018-9-27 08:44
当然可以
作者
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渠梦楠    时间: 2018-9-27 20:38
sobereva 发表于 2018-9-26 20:20
我虽然不用NAMD,但是CHARMM是NAMD御用力场,能给其它程序用就不可能不能给NAMD用

好的,谢谢您的回复!
作者
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渠梦楠    时间: 2018-9-27 20:39
fhh2626 发表于 2018-9-27 08:44
当然可以

好的,谢谢您的回复!




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