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标题: 如何屏蔽选定原子/区域的等值面 [打印本页]

作者
Author: 终_焉 时间: 2018-8-29 18:59
标题: 如何屏蔽选定原子/区域的等值面
本帖最后由终_焉于 2018-8-29 19:09 编辑

我通过Multiwfn对体系进行分析，得到了ELF.cub文件，希望通过VMD逐层显示不同等值面。
但体系骨架被氢包围，因此包围着氢的等值面对显示效果产生了很大干扰。氢周围的等值面不是我关注的要点，我希望骨架的信息能被更好地显示。
因此我希望将氢周围的等值面屏蔽，但是当Drawing Method选为Isofurface时，不能在面板上指认原子。因此请教大家：
在绘制等值面时，VMD中有办法屏蔽选定原子或者区域吗？可以的话大概是什么思路？如果不行的话，大家有其他的建议吗？谢谢大家。

作者
Author: sobereva 时间: 2018-8-29 19:37
VMD里做不到，这是计算格点数据层面上的事情
利用Multiwfn的主功能13可以对某些区域的格点数据进行屏蔽，看Multiwfn手册4.13.4节

作者
Author: 终_焉 时间: 2018-8-29 21:04

sobereva 发表于 2018-8-29 19:37
VMD里做不到，这是计算格点数据层面上的事情
利用Multiwfn的主功能13可以对某些区域的格点数据进行屏蔽， ...

好的。谢谢Sob老师。
我在Multiwfn中，通过将骨架一定距离外的格点数据设置为0，解决了问题。

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