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标题: 如何使用gmx分析分子直径 [打印本页]

作者
Author: myoled 时间: 2018-7-3 09:28
标题: 如何使用gmx分析分子直径
大家好，最近需要用gromacs分析一种组分的分子直径，查资料发现分子直径的定义是：“同类的分子之间质心的最小距离”，请问这个分析如何通过gmx里面的分析命令实现，非常感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2018-7-3 09:35
应当说明你具体哪类分子的直径，一般情况算直径用不着gmx，看
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述
http://sobereva.com/190
使用Multiwfn计算分子的长宽高以及显示分子的主轴
http://sobereva.com/426

如果必须考虑动态效应对直径的影响，用gmx distance

作者
Author: myoled 时间: 2018-7-3 10:01

sobereva 发表于 2018-7-3 09:35
应当说明你具体哪类分子的直径，一般情况算直径用不着gmx，看
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述
http: ...

谢谢sob老师！

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