计算化学公社

标题: gromacs 模拟表面张力时npt出现错误 [打印本页]

作者
Author: shanxitaiyuan 时间: 2018-6-22 11:17
标题: gromacs 模拟表面张力时npt出现错误
在模拟己酸乙酯与月桂酸乙酯混合界面时，能量最小化跑了170000步，但是npt时出现了错误。npt.mdp文件设置如下想问一下是哪里出了问题

作者
Author: sobereva 时间: 2018-6-22 12:22
拓扑文件不合理、参数不合理、初始结构不合理、mdp不合理都可能导致此类报错

如果没有特殊情况，不建议用反应场。直接用PME算静电作用好得多。尝试PME能否跑起来
可以尝试用小点步长，而且用退火设定来缓慢升温

对于界面体系，建议用半各项同性控压

欢迎光临计算化学公社 (http://ccc.keinsci.com/)