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标题: 运行过程出现Warning:质量和原子(范德瓦尔斯)半径将根据原子名称确定…… [打印本页]

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青青青    时间: 2018-5-31 19:12
标题: 运行过程出现Warning:质量和原子(范德瓦尔斯)半径将根据原子名称确定……
错误提示如图,不知道是什么原因造成的:请问这个错误可以忽略吗? (, 下载次数 Times of downloads: 37)

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sobereva    时间: 2018-5-31 19:56
这是因为根据当前输入文件,gmx没法准确获得元素信息,于是gmx就根据原子名、残基名试图去猜各个原子的元素,从而获得质量和范德华半径信息
看输出的文件,如果都猜对了就没问题
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青青青    时间: 2018-6-1 09:10
sobereva 发表于 2018-5-31 19:56
这是因为根据当前输入文件,gmx没法准确获得元素信息,于是gmx就根据原子名、残基名试图去猜各个原子的元素 ...

嗯嗯,谢谢sobereva老师。请问那怎么知道猜没猜对呢?
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sobereva    时间: 2018-6-2 00:05
青青青 发表于 2018-6-1 09:10
嗯嗯,谢谢sobereva老师。请问那怎么知道猜没猜对呢?

你看都输出了什么文件,其中文本形式的,直接打开看看就知道
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青青青    时间: 2018-6-2 15:37
sobereva 发表于 2018-6-2 00:05
你看都输出了什么文件,其中文本形式的,直接打开看看就知道

受教了,谢谢您!




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