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标题: castep的几个基础问题 [打印本页]

作者
Author: yjj 时间: 2018-5-28 17:02
标题: castep的几个基础问题
castep新手，想请教大家几个问题：
1.在优化结构时只有能量和位移收敛，力没有收敛。通过以前的帖子，我知道在Dmol3中可以通过在input文件里添加Opt_Converge_All解决这个问题。我的问题是，Opt_Converge_All这个关键词对castep适用吗？如果适用的话，应该如何添加？
2.请问能否将castep的结构优化轨迹文件处理成像Dmol3那样的可视化文件？
3.在找过渡态时，原子不能正确匹配，这是什么造成的？该如何解决？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-5-28 20:57
1、不适用，CASTEP也没有对应关键字。CASTEP的keywords你可以在help中搜索到。
2、结构优化之后如果成功会正常返回优化的轨迹，如果不成功你需要确定返回计算结果轨迹才会被返回。
3、不匹配的话手工把两个xsd都打开来显示一下，被选中的原子是高亮的，你可以确定一下两个文件高亮的原子是否是对应的手工进行match。

如果你做的是表面反应找过渡态的话，CASTEP计算效率较低，而且也没有过渡态优化。

作者
Author: yjj 时间: 2018-5-28 22:03

卡开发发发表于 2018-5-28 20:57
1、不适用，CASTEP也没有对应关键字。CASTEP的keywords你可以在help中搜索到。
2、结构优化之后如果成功会 ...

很高兴能得到您的解答。我还有点疑惑想请教您：
1.根据您的经验我现在得到的结构（能量和位移收敛，力不收敛）可靠吗？
2.我是在服务器上提交的作业，结构优化也成功了，请问返回的优化轨迹是哪个文件呢？（根据help，.geom文件是结构优化的轨迹文件，但它是文本文件，不能直观的反应优化的过程）
3.我打开两个xsd文件后，发现两个文件的高亮原子并不是正确对应的，比如说我想让两个xsd文件的第60个氧原子匹配，应该如何操作呢？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2018-5-28 22:46
1、不可靠。
2、有xsd、castep、geom，然后你可以在CASTEP Analysis里面的structure来creat一个xtd文件。
3、你应该选中你想匹配的两个原子点match。

作者
Author: yjj 时间: 2018-5-29 14:52

卡开发发发表于 2018-5-28 22:46
1、不可靠。
2、有xsd、castep、geom，然后你可以在CASTEP Analysis里面的structure来creat一个xtd文件。
...

谢谢卡开发发，我会生成xtd文件了。现在的问题是我无法同时选中我想要让匹配的两个原子，这个应该怎样解决呢？

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