标题: 关于gromacs中控制文件中nstcomm和comm-grps的问题 [打印本页] 作者Author: 虔诚的人 时间: 2018-5-23 10:36 标题: 关于gromacs中控制文件中nstcomm和comm-grps的问题 今天尝试做gromacs教程中的umbrella采样模拟,对mdp文件存在疑惑。; These options remove COM motion of the systemnstcomm = 10 ; frequency for center of mass motion removal
comm-mode = Linear ; Remove center of mass translation
comm-grps = System ; group(s) for center of mass motion removal, default is the whole system
想请问一下各位老师、朋友,在拉伸过程中这样设置的原因是什么?
ps:分别是:质心移动的输出频率?移除质心的转动?质心为整个系统?----也就是控制在拉的过程中整个系统的质心不发生转动?