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标题: Amber的QMMM计算环氧丙烷+离子液体体系报错 [打印本页]

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Author: 16whzhengdn 时间: 2018-5-21 11:36
标题: Amber的QMMM计算环氧丙烷+离子液体体系报错
计算环氧丙烷+离子液体体系的时，盒子中分别放纯的离子液体或者纯的环氧丙烷时，都能正常运行到正常结束。一旦掺入对方的一个分子时，就会出现下面这种报错，请问老师，我需要修改什么才能让混合体现正常运算下去

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Author: 小范范1989 时间: 2018-5-21 12:12
咨询一下楼主，是amber+gaussian做的QM/MM？还是amber自己做呢？
如何将两者搭配起来的呢？
谢谢指点

作者
Author: beyond 时间: 2018-5-21 18:42

小范范1989 发表于 2018-5-21 12:12
咨询一下楼主，是amber+gaussian做的QM/MM？还是amber自己做呢？
如何将两者搭配起来的呢？
谢谢指点

http://nf.nci.org.au/~vvv900/monash/amber-gaussian/index.html

这里有一个教程

作者
Author: 小范范1989 时间: 2018-5-21 20:20

beyond 发表于 2018-5-21 18:42
http://nf.nci.org.au/~vvv900/monash/amber-gaussian/index.html

这里有一个教程

谢谢楼主指点。

作者
Author: agent99 时间: 2018-5-22 01:35
你用的sander.MPI还是sander？好几年前碰到过类似问题，貌似和MPI并行有关，如果你用的是前者的话，换后者试试

作者
Author: 16whzhengdn 时间: 2018-5-22 17:29

agent99 发表于 2018-5-22 01:35
你用的sander.MPI还是sander？好几年前碰到过类似问题，貌似和MPI并行有关，如果你用的是前者的话，换后者 ...

我用的sander.MPI，非常感谢你的提示，我试试

作者
Author: 16whzhengdn 时间: 2018-5-22 19:27

agent99 发表于 2018-5-22 01:35
你用的sander.MPI还是sander？好几年前碰到过类似问题，貌似和MPI并行有关，如果你用的是前者的话，换后者 ...

还是一样的问题，到了这个地方就算不下去了

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