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标题: 在模拟扩散系数时，建了5*5*5的盒子填进72个正庚烷分子 108个接下来nvt跑了15000 [打印本页]

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Author: shanxitaiyuan 时间: 2018-5-18 09:58
标题: 在模拟扩散系数时，建了5*5*5的盒子填进72个正庚烷分子 108个接下来nvt跑了15000
在模拟扩散系数时，建了5*5*5的file:///d:\Documents\Tencent Files\972306878\Image\C2C\296265DB90D5CD965562DE289622490A.jpg盒子填进72个正庚烷分子 108个十二烷分子，接下来nvt跑了15000步，最小化没问题，nvt跑完后出现真空区，还有一些分子在外面这是什么原因

file:///d:\Documents\Tencent Files\972306878\Image\C2C\296265DB90D5CD965562DE289622490A.jpg

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Author: shx 时间: 2018-5-18 17:20
这个是周期性边界条件的原因，你多显示几个盒子就可以看到这些分子已经聚集了。

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Author: sobereva 时间: 2018-5-18 23:15
注意恰当命名标题
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

作者
Author: shanxitaiyuan 时间: 2018-5-21 09:09

shx 发表于 2018-5-18 17:20
这个是周期性边界条件的原因，你多显示几个盒子就可以看到这些分子已经聚集了。

我只建了一个盒子，怎么显示多个盒子呢命令怎么输

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Author: sobereva 时间: 2018-5-23 18:39
VMD里可以显示多个镜像

再次提醒：
注意恰当命名标题
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

编辑帖子可以改标题

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